360度围观DNBSEQ-T7 超级性能怪兽 | 微课回顾
作为全球日生产能力最强的基因测序仪，DNBSEQ-T7已获得NMPA认证和CE-IVD认证，同时提供全流程自动化整体解决方案。本期回顾，将与大家一起对这台超级性能怪兽进行360度围观。
超级通量模式
生产级的DNBSEQ-T7通量惊人，单张载片最大有效reads数可达5000M，最大数据量达1.5Tb，四载片连载日产数据量高达6Tb，广泛适用于全基因组测序（60例/天）、超高深度外显子组测序（400例/天）、宏基因组测序（1000例/天）、肿瘤Panel测序（6000例/天）等大型测序项目。
表1 DNBSEQ-T7测序模式适用的文库类型
*单张载片产生的数据量与测序模式相关
超级运行模式
DNBSEQ-T7拥有4联载片平台，灵活支持1-4张载片独立运行：每张载片在上机后可自动完成清洗和回收，能够在24小时内无缝衔接多轮测序。
表2 DNBSEQ-T7性能参数一览表
[1]SE50面向新冠疫情特别开发，限量供应，优先满足新冠病毒基因检测需求
[2]PE150将于2020年6月底上市
*高于Q30的碱基百分比及运行时间是特定标准文库通过整个运行平均所得，实际应用表现受样本类型、文库质量、插入片段长度等影响。
超级速度模式
SE50~5小时
PE100~20小时，PE150~24小时
以新冠病毒基因测序为例，DNBSEQ-T7使用SE50进行新冠病毒测序，5~6个小时可完成一轮测序，如高通量宏基因组测序（100M reads/样本），每轮可检测~128例样本，每天可做4轮检测；再如多重测序筛查（5M reads/样本），每轮可检测~2300例样本，每天可做3轮检测，日检测通量近万。
一站式整体解决方案
围绕DNBSEQ-T7，华大智造提供全面的自动化解决方案。在上游的样本前处理方面，可适配华大智造自动化样本制备系统MGISP系列（MGISP-960/MGISP-100）；在下游的计算存储方面，华大智造推出了集计算、存储和分析软硬件为一体的“T7伴侣”：ZTRON生信自动化服务平台。在整体的实验室管理方面，华大智造ZLIMS实验室信息管理系统提供端到端的解决方案。
数据表现
DNBSEQ-T7的数据表现一直是业内关注的焦点，目前已支持10余种不同文库和测序类型，包括WGS、WES、WGBS等常见库类型，及stLFR、RNA、单细胞等特殊文库类型。此外，在DNBSEQ-T7平台上，对不同类型的文库混合、单双INDEX混合进行了测试，数据结果表现优异。
*DNBelab C系列单细胞RNA文库制备套装近期上市
表4 基于DNBSEQ-T7的人标准样本WGS案例
温馨提示：
部分原始数据可登录华大智造官网，点击菜单栏“支持”，进入“Demo”选项自行下载分析。
已发表文章
靠谱
韩国基因组学中心（KOGIC）等机构在BioRxiv发布了基于DNBSEQ-T7的多平台测序性能对比研究，结果表明：华大智造DNBSEQ测序平台和其他平台在测序质量、覆盖均匀性、GC覆盖度和变异准确性方面均有可比性，且相较之下更具成本优势。
伦敦帝国理工学院传染病流行病研究中心，潍坊疾控中心等单位基于DNBSEQ-T7的基因组数据用于对潍坊市28例新冠病毒阳性样本进行测序，基于数据分析建立了流行病学系统模型，对基因组流行病学的研究提供了地域依据。
温馨提示：
DNBSEQ-T7已获得NMPA认证和CE-IVD认证。
FAQ精选
Q1: DNBSEQ-T7是配了四个独立的照相机吗？
A1: DNBSEQ-T7配备四联载片平台，各个载片的生化反应均可独立进行，四个工作载片共享一套光学系统。光学系统具备四个独立的相机，搭配超高灵敏度和超高分辨率的TDI线阵扫描技术，大大提升成像速度，实现高效有序的测序数据生产。
Q2: DNBSEQ-T7的WES套装，是否可以在MGISEQ-200/MGISEQ-2000两个平台上使用？
A2: 可以的。华大智造测序仪都是基于DNBSEQ技术：通过不同的文库制备方法获得PCR产物后，转化为单链环状DNA，然后制备DNA纳米球，加载到测序载片，进入测序仪测序。在满足测序通量要求下，华大智造的文库制备套装在不同华大智造测序平台上均兼容。
Q3: 测试下机之后，要多久才能转成FASTQ文件？速度-数据量的关系是怎样的?
A3: DNBSEQ-T7测序结束生成的是CAL文件，它是basecall软件生成的二进制文件，包含碱基序列信息。写fq推荐在外置的服务器上完成，相比在T7测序仪上写fq的优点在于不占用仪器的测序资源。
MGI提供外置WFQ服务器，可供采购：服务器上有GPU加速，1-2小时写完一张PE150的数据。
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